Nie ma obowiązkowych szczepień. W Azerbejdżanie nie ma w zasadzie zagrożeń dla zdrowia. Jedynie na terenach stepowych, w przygranicznej strefie z Iranem bardzo rzadko zdarzają się przypadki zachorowań na malarię. Góry mają bardzo zdrowy klimat, ich mieszkańcy słyną z długowieczności. Na równinach nie należy pić nieprzegotowanej wody, bez obaw natomiast można pić wodę w górach z górskich źródeł. Nie należy zbyt długo przebywać latem na plaży, bowiem słońce operuje bardzo silnie.
Sytuacja w publicznej służbie zdrowia w porównaniu z latami 90., ulega znacznej poprawie. Szpitale stopniowo są remontowane oraz buduje się nowe, lecz dzieje się tak głównie w Baku i większych miastach. Spora jednak część szpitali i przychodni w małych miejscowościach na prowincji, ma stare wyposażenie i potrzebuje remontu.